Sci Rep：miRNA比我们想象的更加复杂

科学家们发现，人体内的非经典microRNA沉默比人们之前设想的更为普遍，这意味着microRNA的作用应该更为复杂。

MicroRNA（miRNA）通过与各种mRNA 的3´端进行互作，调控蛋白编码基因的表达。这些互作位点与miRNA的头几个核苷酸相匹配，人们将其称为“seed”区域。在碱基配对的基础上，miRNA会使其作用目标降解，或者阻止mRNA翻译出氨基酸序列。正因为有着这样的规则，目前研究者们大多是在寻找能与“seed”区域完美配对的靶标。

八月八日Scientific Reports杂志上发表的一项新研究指出，miRNA的非经典结合其实非常普遍，也就是说miRNA有更广泛的作用目标，既包括蛋白编码区域也包括非编码区域。

“这一发现可以解释，为何人们在将microRNA转化为治疗药物时遇到了困难（从癌症到糖尿病），”文章的资深作者，Thomas Jefferson大学的Isidore Rigoutsos博士说。“我们对于miRNA在机体中的作用机制其实还很不了解。”

这项研究补充了Jefferson团队之前的一些工作，向人们展示了更为复杂的miRNA“靶标组”（targetome），即miRNA的所有目标RNA。“研究显示，即使是那些非常保守的miRNA，在不同生物甚至人体不同组织之间的行为也大相径庭。”

以一个所有脊椎动物都表达的癌症相关miRNA为例，它在小鼠胚胎干细胞中结合九百多个不同的位点，但在小鼠脑细胞中不与任何位点结合，在人类胰腺细胞中只结合25个位点。这说明该分子很可能在不同物种、不同细胞类型之间，承担了各不同而且不相重叠的功能。

研究人员在小鼠和人的七种组织中，对miRNA及其作用靶标进行了研究。他们发现，许多miRNA和靶标都只是粗略的结合，它们并没有形成格式良好的持续性配对，miRNA的seed区域出现了凸起和摆动。此外，miRNA的最佳拍档往往出现在意想不到的位置，比如mRNA转录本的5´非翻译区，或者没有编码蛋白的RNA转录本。

目前绝大多数研究还在针对，miRNA seed区域与mRNA 3´非翻译区域的完美配对。而事实上，还有大量其他的结合位点存在。这说明在人们没有检测到的地方，也发生着miRNA的调控事件。这些事件在不同生物中有着明显的差异，正因如此，对动物有效的miRNA药物常常不能很好的转化到临床上去。