DNA测序为个体化癌症治疗奠定基础（下）

近日来自华盛顿大学医学院的科学家们利用强大的DNA测序技术不仅确定了一位癌症患者的根源基因突变——被视为是个体化癌症治疗的关键，并且绘制了疾病的基因演变图谱，监控了对于治疗的反应。

上接：DNA测序为个体化癌症治疗奠定基础（上）

利用基因组研究所开发的一项称为“深度数字测序”（ deep digital sequencing）的技术，她们对患者肿瘤样品中的个别突变进行了超过1000次的测序。从而提供了每位患者肿瘤基因组每种突变频率的读值，研究人员基于此绘制出了随病情进展癌细胞的遗传进化图谱。

他们发现随着癌症发展，肿瘤获得了一些新突变，然而却始终保留着一些初始的突变群，它们在细胞致癌作用中占据首要地位。这些研究发现表明如果能针对癌症早期发生的遗传变异，癌症靶向药物或可能更有效。而靶向仅存在于后期演变癌细胞中突变的药物则有可能不会对疾病产生太大的效应，因为它们无法杀死所有的肿瘤细胞。

Mardis认为测序癌细胞的完整基因组对拼凑癌细胞进化方式精确图像而言是必不可少的。如果研究人员仅对涉及基因的小部分基因组测序，那他们就不具备随时间追踪突变频率的统计能力（仅有1-2%的基因组包含基因）。

在另一项对绝经后雌激素受体阳性乳腺癌妇女的III期临床试验研究中，华盛顿大学的研究人员证实测序可以帮助预测哪些妇女将对芳香酶抑制剂治疗产生反应。在手术前这些患者通常被给予降低雌激素的药物。然而却只有一半的雌激素受体阳性乳腺癌妇女对这些药物产生反应，医生无法预测哪些患者将从中受益。

有趣的是，通过对芳香酶抑制剂治疗前后的患者乳腺肿瘤进行测序，研究人员发现在反应患者体内发生了实质性的基因组变化，而无应答患者的基因组则并未通过治疗发生显著的改变。

“从未有人以这种分辨率水平来观测治疗反应。谁正对治疗产生应答一目了然，”Mardis说。

此外，研究人员还在靶向缺陷蛋白的小分子抑制剂药物对应的乳腺肿瘤中鉴别出了一系列的突变。这些研究结果表明对于芳香酶抑制剂无应答的妇女，治疗方案或许应联合常规的化疗和指定的小分子抑制剂。

Mardis 说：“我们认为其重要意义是表明对芳香酶抑制剂耐受的患者可能还有其他的治疗选择。随着我们不断地向前进展，我们认为测序将提供更多至关重要的信息帮助确定患者最佳的治疗方案。”