DNA测序为个体化癌症治疗奠定基础（上）

近日来自华盛顿大学医学院的科学家们利用强大的DNA测序技术不仅确定了一位癌症患者的根源基因突变——被视为是个体化癌症治疗的关键，并且绘制了疾病的基因演变图谱，监控了对于治疗的反应。

华盛顿大学医学院基因组研究所主任Elaine Mardis 说：“我们正通过测序肿瘤样品寻找临床相关的资料开展发现取向（discovery-oriented）的研究。基因组测试可在患者治疗的多个时间点发挥功用，以鉴别肿瘤基因组中的‘驱动’突变，并确定携带这些突变的细胞是否已被治疗清除。”

Mardis在4月1日芝加哥召开的美国癌症研究协会年度会议开幕式上表示这项研究正在帮助指导设计未来癌症临床试验，在试验中治疗决策主要基于测序的结果。Mardis还是医学院塞特癌症中心（Siteman Cancer Center）和巴恩斯－犹太医院（Barnes-Jewish Hospital）的成员。

迄今为止，Mardis和她的同事们已经对来自700多名癌症患者的肿瘤细胞进行了全基因组测序。通过比对癌症患者肿瘤细胞与健康细胞的遗传序列，她们可以找出每个患者肿瘤潜在的突变。

研究人员利用全基因组测序获得的信息，根据肿瘤的基因组成而非肿瘤部位对其进行了重新分类。例如在乳腺癌患者中，Mardis及同事发现了大量驱动基因突变，而这些基因以前从未显示与乳腺癌相关。

其中一些基因已被确定存在于前列腺癌、结肠癌、肺癌或皮肤癌，以及白血病和其他癌症中。靶向这些基因突变的药物，包括伊马替尼（imatinib）、鲁索利替尼（ruxolitinib）和舒尼替尼（sunitinib），虽尚未获准用于治疗乳腺癌，但也都已经上市用于治疗其他癌症。

“我们正在多种肿瘤类型中寻找已上市药物可能潜在靶向的基因突变，”Mardis说。

Mardis认为肿瘤学家评估个体化癌症治疗的潜在利益还需要进行模式转换。尽管临床试验通常涉及了随机安排患者接受特定的治疗方案，然而个体化医疗方法还需要基于每位患者肿瘤的潜在突变来选择药物。

Mardis承认：“可为每位患者提供的所有治疗方案并不一定适合精心设计的临床试验。我们还需要更多的灵活性。”

在癌症过程中，基因突变的发展也可能对治疗决策具重要的意义。在近期的一项研究中，Mardis和她的研究小组绘制了白血病的遗传进化图谱，发现的一些线索表明癌症应该靶向性针对疾病早期形成的突变。

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