Nature：核糖体启示录

核糖体是将特定遗传密码翻译为蛋白质的重要细胞机器。核糖体有三种类型：原核生物（比如细菌）的70S核糖体，真核生物（包括真菌、植物和动物）细胞质的80S核糖体，以及真核生物线粒体的55S核糖体。

Garreau de Loubresse等人在本期Nature杂志上，报告了酿酒酵母80S核糖体的16个晶体结构，这些结构揭示了不同化合物与核糖体的结合模式。这项研究向人们展示了，抑制或调节翻译功能的化合物是如何发挥效果的。

由许多部件组成的核糖体就像一个精密的钟表，这些部件对于核糖体的正常功能缺一不可。目前临床上使用相关治疗药物主要靶标两个关键的区域，大亚基的肽酰转移酶核心和小亚基的解码核心。研究人员发现，化合物的结合位点都在这两个核心区域中间或者边缘。

成像化合物与其靶标互作时的三维结构，对于理解化合物的作用机制至关重要，有助于提高其治疗价值。在过去十年里，70S核糖体一直是研究这种互作的理想平台。现在这项研究为人们直接展示了，真核80S核糖体与化合物之间的互动。这一成果有助于人们设计安全有效的药物，对多种疾病进行治疗，比如囊性纤维化、肿瘤转移和重型血友病。

研究表明，抑制肿瘤增殖的戊二酰亚胺类化合物（cycloheximide and lactimidomycin），能抑制80S核糖体的蛋白合成，但对70S核糖体没有作用。晶体结构显示，这些化合物结合在肽酰转移酶核心的出口处。在原核生物70S核糖体中，戊二酰亚胺类化合物的结合位置被堵住。

这项研究的生化数据还揭示了上述化合物的不同作用机制。Cycloheximide在蛋白翻译的任何时候都能结合核糖体，阻止核糖体底物离开肽酰转移酶核心。Lactimidomycin的结合速率远低于核糖体底物，在蛋白翻译时无法进入核糖体，不过可以在翻译开始前结合和阻断这一过程。研究人员认为，这两种化合物的不同作用机制，是由它们的大小决定的。

随着冷冻电镜等技术的发展，我们对核糖体等细胞机器的理解无疑将迎来巨大的突破。理解各种化合物对80s核糖体的具体影响，有助于人们更好的调节它的活性。