新方法制造无差错长DNA序列

近日《自然—方法学》介绍了一种可制造包含了数千碱基对的无差错长DNA序列的方法。该方法采用单分子实时（SMRT）测序技术并在无参照测序组的情况下简化了细菌基因组的组装过程，以便更好地了解细菌基因组在生态学和病理学中充当的角色以及跟踪其进化。

细菌基因组通常是由通过第二代测序设备产生的短DNA序列片段拼合而成，但这样产生的基因组存在着一些难以填满的空隙。最近研发出的一些混合法将不同测序技术结合并填充了短序列组装后留下的空隙，比如那些由常规第二代测序设备产生的空隙和那些由SMRT测序技术产生的虽然精确度较差，但更长一些的序列片段的信息所导致的空隙。这种方法需要复杂的测序库和测序设备。

许多测序应用对长序列一直都有着较高需求，但是错误率限制了其效用。Jonas Korlach等人设计的方法利用同一序列库中的较短序列片段修正了长序列片段中的错误，使得细菌基因组和人造细菌染色体的组装在全自动流水线中具有高质量、无空隙的优点。同时，该方法还有效解决了重复测序中的一些难题。