基因表达分析新技术（三）

科学家们为了能深入了解特异性基因表达，发展了许多实验技术，比如芯片技术，PCR，高通量测序等，但是要想得到精确的结果，仍然依赖于实验操作人员对于技术掌握的熟练程度。而且随着基因表达研究越来越多，为了确保公布的结果的精确性，对于相关分析也越来越严格。不过所幸目前也有了更多基因表达分析相关的产品，这些产品带来的新技术也许能帮助我们解决难题。

计数表达

“过去所有用于分析基因表达的方法都是相对间接的方法——通过转录标记，和芯片杂交检测表达水平”，来自Illumina国内公司的资深科学家Gary Schroth说，“目前发展趋势很清楚，世界正朝着测序，或者说是计数分析发展”，RNA测序也更多的计数分析，直接分析生物样品中的分子特征。

2007年1月，Schroth研究组研发了一种称为RNA-seq的实验方法，这种方法能完成cDNA全长的测序。在短短几年间，这种技术已经应用于多篇发表文章中，正如Schroth自己所说的，“现在，有超过300份同行评审发表文章采用了RNA-seq方法”，他也提及了增长的高通量——从2007年的每次完成4000-6000万发展到了今天Illumina HiSeq 2000系统的3亿。读长也翻了三倍，而且如今研究采用的也大多是双末端测序方法。

同时一些上市的试剂盒也促进了RNA测序的发展，比如Illumina2010年底推出的TruSeq RNA Sample Prep Kits，这一试剂盒能从总RNA生成文库，并与Illumina测序产量兼容。与之前的方法相比，预混液试剂排除了大部分移液步骤，并减少了纯化次数，让手工操作时间降至最低。全新的自动化友好的流程形式能够平行处理最多96个样品。通过目前新一代测序平台上最易用的样品制备流程，这实现了经济、高通量的RNA测序研究。