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揭示miRNA调控机制

日期:2011-07-18 08:23:30

近日,哈尔滨医科大学的研究人员在生物信息学领域的世界顶级杂志《生物信息学简讯》(Briefings in Bioinformatics)上发表了题为“解析人类miRNA(微小核苷酸)对子通路的调控影响”的科研论文,SCI影响因子高达9.283。 

领导这一研究的是哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院院长、国家高技术研究发展计划(863计划)课题组负责人李霞教授。其多年来一直从事生物信息学领域的教学和科研工作,作为学术带头人,创建了哈医大生物信息学学科,先后承担科研课题30余项,在国内外重要学术刊物和学术会议上发表学术论文120余篇。近年来,李霞教授致力于复杂疾病功能基因识别方法的研究在复杂疾病基因作图的模式识别方法研究领域做出重要贡献,论文“Gene mining: a novel …”曾受到了Nobel奖得主Rich Roberts博士的好评。

miRNA是一类单链的非编码RNA分子,在转录后水平调控基因的表达。miRNA参与许多重要的生物学过程,如发育、分化、增殖等,同时,越来越多的研究报道miRNA与多种人类复杂疾病密切相关,如癌症、糖尿病、心血管疾病等。

在先前的研究中李霞课题组发现:某些疾病的发生并不是整个生物学通路异常所导致的,而更可能是通路的某个局部区域(子通路)发生了功能失调。此次,李霞教授带领课题组首次在系统水平识别出了480个人类miRNA所调控的子通路,筛选出了miRNA协同调控的功能相关的子通路簇,并深入研究了癌症等123种疾病相关的miRNA对子通路的调控特点。结果提示从协同的角度研究人类microRNA对子通路调控的影响不仅是系统解释microRNA调控机理的一个重要突破点,而且对于研究microRNA在疾病发生、发展过程中发挥作用的机制具有重要意义。

该研究是研究人员首次从全局性的角度建立miRNA对子通路的调控关系,并对miRNA(尤其是疾病miRNA)的调控特点进行了深入分析。该成果不但有助于解析miRNA的调控机制,而且对于准确定位疾病基因具有重要的参考和帮助。

此外,为了将计算分析的成果应用到生物学实验或临床研究中,李霞教授的课题组还开发了方便、快捷的网络分析平台。生物医学家只要选择感兴趣的miRNA,平台就会提供包括该miRNA关联的疾病、靶基因、子通路以及靶基因在子通路中的位置等信息,这些结果以可视化的通路形式给出,从而更直观地指导进一步实验的开展。