多国研究强调了454测序系统在鉴定血癌上的可靠性

在上月举行的52届美国血液病协会的年会上，多项研究结果强调了高通量测序在深度鉴定血癌上的价值，包括白血病及其他恶性血液病。

研究人员使用罗氏454的Genome Sequencer FLX和GS Junior系统对与癌症相关的已知基因（如KRAS、RUNX1、EZH2和TET2）开展了定向重测序，以便检测出与疾病相关的基因突变。通过对大量白血病样品的基因组序列测序，研究人员成功鉴定出新的突变，以及将个体分成不同的疾病风险亚型。

白血病及其他骨髓增生性疾病有多种亚型，会导致血细胞异常生长。鉴定出癌症的分子遗传图谱对疾病的诊断和预后很关键，并且能够检测出治疗中或治疗后耐药性克隆的出现。目前鉴定白血病类型的技术主要有几种：传统的Sanger测序、细胞遗传学和免疫组化，但是这些都相当耗时，有时不能深入分析。

于是，慕尼黑白血病实验室（MLL）开始采用新一代测序来分析血癌。MLL的联合创始人兼CEO Torsten Haferlach教授表示：“通过我们使用454测序系统的大量研究和开发工作，我们发现该技术有潜力实现日常操作中的突变分析，我们也开发出一些白血病相关标志物（如RUNX1和TP53）的分析，以检测分子畸变。”

慕尼黑白血病实验室还领导了一项国际研究，以调查454测序系统在各地之间的重复性，此项研究结果也在会议上提及。这个名为“IRON（Interlaboratory RObustness of Next-Generation Sequencing）”的项目研究了454系统在定向扩增子重测序上的应用，以鉴定慢性粒细胞白血病样品中的已知疾病相关基因。

来自6个国家的10个实验室利用GS FLX系统对同样18个样品中的TET2基因进行了测序和分析。结果显示各地的突变检测有着高度一致性，包括那些Sanger测序检测不到的新颖变异。检测稀有变异的灵敏度低至1-2%频率，再加上高质量的读长，让该系统成为未来临床应用的理想选择。454生命科学的总裁兼CEO Christopher McLeod表示：“我们很高兴看到这项研究的初步结果，它重申了各地HLA基因分型和HIV变异检测的可靠性和灵敏度。随着GS Junior系统在市场上迅速崛起，我们很高兴与更多的研究人员共同努力，为多个未来的医学应用开发出目标特异的分析。”

据悉，该公司计划在今年初推出第一个目标特异的分析，是在GS Junior系统和GS FLX系统上对HLA进行基因分型。