生化所PLOS ONE杂志解析脊髓小脑共济失调症相关蛋白模体
日期:2010-10-28 16:19:44
来自上海生科院生化与细胞所的研究人员于10月7号在美国PLoS ONE杂志发表论文。论文阐述了III型脊髓小脑共济失调症相关蛋白ataxin-3(AT3)中的串联泛素结合模体(ubiquitin-interaction motif,UIM)的构象变化和UIM与泛素链结合的协同效应。
领导这一研究的是生化与细胞所的胡红雨研究员,其早年毕业于复旦大学,曾以访问学者的身份赴美Scripps研究所进行合作研究,现任国际刊物Protein & peptide Letters 编委。主要研究方向是蛋白质折叠和相互作用。
UIM是一类拥有泛素结合和促进泛素化功能的短肽序列。UIM存在于许多不同类型的蛋白质中, 其氨基酸序列高度保守。除了与单泛素(mono-Ub)结合外,UIM还能够与多泛素链(poly-Ub)结合。AT3是一种含有多聚谷氨酰胺(polyQ)的蛋白质,其polyQ附近有两个相连的UIM序列(UIM12),对于结合泛素和促进底物泛素化有着十分重要的作用。
宋爱新博士等人利用核磁共振的方法解析了UIM12在自由状态和结合泛素状态下的溶液结构,每一个UIM模体都由一个a-螺旋组成。当UIM12处于自由状态时,这两个螺旋之间没有固定的取向,而当结合了泛素后,这两个螺旋便形成了典型的螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix)的折叠构象。核磁共振动态学数据也显示,当UIM12结合了泛素后,两个螺旋间的连接部分变得更为刚性。通过核磁共振化学位移干扰(CSP)和等温滴定量热(ITC)实验,发现UIM12比单独的UIM1、UIM2与泛素的结合力更强;而与结合单泛素相比,UIM12更倾向于结合通过K48或K63连接的二泛素链,并且两个UIM之间的连接部分对于UIM12与二泛素链的结合起着重要作用。这些证据表明UIM12的连接区域通过构象和动态性质的变化,使两个UIM模体以协同效应的方式与单泛素或二泛素链结合,这也许与蛋白质识别不同类型的多泛素链和泛素化底物有关。
该项研究与上海药物所林东海课题
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