清华大学陈柱成课题组Nature发表结构生物学重要研究成果
日期:2016-12-07 08:47:21
染色质重塑蛋白ISWI与Snf2、Chd1、Ino80同属于SWI2/SNF2 家族。ISWI是一些染色质重塑复合体的催化亚基,这些复合物沿着基因组DNA移动核小体,协助复制前进、转录抑制、异染色质形成和其他细胞核过程。
ISWI的ATPase马达是一个自主的重塑机器,其C端HSS结构域负责结合核小体外的linker DNA。ISWI催化核心的活性受到AutoN和NegC结构域的抑制,而H4尾巴和核小体外DNA对此起反作用,以确保适当的染色质景观。目前人们还不清楚AutoN和NegC是如何抑制和调控ISWI的。
清华大学陈柱成(Zhucheng Chen)教授的团队对此进行了深入研究。他们十二月六日在Nature杂志上发表文章,揭示了染色质重塑蛋白ISWI的结构和调控机制。陈柱成教授曾师从著名结构生物学家尼古拉-帕夫拉提奇,研究DNA损失修复以及DNA同源重组的分子机理。2011年回国参加工作,2012年入选中共中央组织部“千人计划”青年组。当前的主要研究方向包括微丝的动态调控机制,及染色质重组复合物结构与功能。
研究人员获得了嗜热酵母(Myceliophthora thermophila)ISWI及其与组蛋白H4形成复合体时的晶体结构。研究显示,N端AutoN结构域含有两个抑制性元件,它们共同结合core2结构域,使酶保持在失活构象。H4与core2结构域的结合位点与其中一个AutoN结合位点一致,这解释了H4激活ISWI的机制。C端NegC结构域参与了core2结构域的结合,作为ISWI的变构元件对核小体外DNA长度进行应答。
近年来,陈柱成教授陆续发表了多项结构生物学研究成果。前不久,他领导研究团队首次获得了细胞核肌动蛋白N-actin复合体的晶体结构,为人们揭示了N-actin的主要结构特征。这项研究于七月二十五日发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。
陈柱成教授的研究团队此前还在Nature Structural & Molecular Biology杂志上发表文章,揭示了染色质重塑蛋白Swi2/Snf2在静息状态下的晶体结构。这个家族的蛋白通过移动、去除和重建核小体,在真核细胞中调控大量的核酸事务。
去年八月,陈柱成教授与俞立教授等人合作证实,CapZ通过促进隔离膜(isolation membrane)内的肌动蛋白组装调控自噬体膜的形成。自噬是一个相当保守的细胞过程。自噬可以清除蛋白质积聚物、受损线粒体以及外来病原体,平衡细胞生长和发育过程中的物质合成与分解。自噬与多种生理过程和人类疾病有关,是生物医学研究领域的一大热点。