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清华大学PNAS发表蛋白转运新成果

日期:2015-04-08 08:58:07

 ABCATP结合盒)转运蛋白是一个古老而庞大的蛋白家族,包括一百多种膜转运蛋白。这种转运蛋白广泛存在于细菌、植物和哺乳动物的各种细胞中,主要功能是利用水解ATP的能量来驱动物质跨膜运输。ABC转运蛋白参与了多种物质的转运,底物可以是离子、单糖、氨基酸、磷脂、肽、多糖和蛋白质。大部分ABC蛋白由两个跨膜结构域和两个核苷酸结合结构域组成。

 

根据物质转运的方向,ABC转运蛋白可以分为内向转运蛋白(importer)外向转运蛋白(exporter)。日前,清华大学和柏林洪堡大学的研究团队获得了一个氨基酸ABC转运蛋白的晶体结构,揭示了它与底物特异性结合的结构基础。这项研究发表在四月六日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上,文章的通讯作者是清华大学生科院的杨茂君(Maojun Yang)教授和柏林洪堡大学的Erwin Schneider

 

之前有研究表明,ABC外向转运蛋白和内向转运蛋白通过共同的机制起作用,涉及面向内(inward-facing)和面向外(outward-facing)状态之间的转换。不过,人们并不清楚ABC转运蛋白的具体作用机制,尤其是其底物识别机制。

 

研究人员从腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tengcongensis)中获得了一个氨基酸ABC内向转运蛋白Art(QN)2,分析了该转运蛋白结合不同底物时的分子结构。这项研究为人们展示了跨膜结构域ArtQ和核苷酸结合结构域ArtN的组织形式,以及一个跨膜的底物转运通道。

 

值得注意的是,Art(QN)2每个跨膜结构域都有一个带负电的口袋,形成了负电的内部通道,允许带正电的氨基酸通过。研究人员在脂蛋白体中对Art(QN)2进行功能分析,发现它会根据底物进行构象变化,刺激ATPase的活性。

 

这项研究阐明了ABC转运蛋白的一种底物结合模式,可以帮助人们更好的理解ABC转运蛋白选择和转运底物的具体机制。