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何川教授点评RNA甲基化重要成果

日期:2015-03-24 08:53:22

 众所周知,DNA和组蛋白的表观遗传学修饰是基因表达调控的关键。不过,人们对RNA上的类似修饰还知之甚少。m6AN6-methyladenosine)是真核生物中最常见的mRNA内部修饰。尽管人们四十年前就已经发现了它的存在,但研究者们才刚刚开始理解m6A的生物学功能。

 

m6A甲基化是人们发现的首个可逆性RNA修饰。之前的全转录组分析,揭示了m6A在哺乳动物细胞和组织中的分布模式。这种修饰是哺乳动物所必需的,可能与细胞分化和发育有关。

 

著名华人学者,芝加哥大学的何川(Chuan He)教授日前在Genome Biology杂志上发表文章,通过点评m6A研究的最新进展,探讨了这种修饰的功能和作用机制。

 

m6A决定胚胎干细胞的命运

 

今年一月份Geula等人在Science杂志上发表文章,展示了m6A甲基化在小鼠胚胎干细胞(mESC)起到的重要作用。研究表明,m6A能够结束mESC的原始态多能性,促进其进行分化。

 

胚胎干细胞来源于早期胚胎,具有分化为任何细胞类型的潜力。小鼠胚胎干细胞分为原始态多能性(Naïve pluripotency)和始发态多能性(primed pluripotency)两种状态,始发态多能性是原始态多能性之后的发育阶段,已经为分化做好了准备。

 

Geula等人通过siRNA筛选发现,m6A转移酶Mettl3是终结小鼠原始态多能性的一个重要调控子。全转录组分析显示,原始态多能性基因和定量分化基因的转录本80%被甲基化,也就是说胚胎干细胞的原始态和始发态都受到m6A的控制。研究人员发现,甲基化会缩短mRNA的半衰期,减少其丰度。也就是说,去除METTL3会增加已表达基因的丰度和支配性。举例来说,在原始态中占主导的是多能性基因,去除m6A甲基化就会把细胞困在这个状态。

 

深挖表型背后的机制

 

何川教授指出,从目前的研究来看,m6A会降低mRNA转录本的稳定性。小鼠胚胎干细胞的表型由占主导地位的转录本决定,而去除m6A会加强这一趋势。虽然人们还不清楚m6A是如何影响mRNA稳定性的,不过这可能与YTHDF2有关。

 

除了调节mRNA稳定性以外,m6A可能也会影响RNA剪切和其他RNA加工过程。总的来说,每发现一个m6A特异性结合蛋白(或“读取器”),就应该有一个相应的功能。因此,鉴定和分析m6A特异性结合蛋白对研究m6A功能很有帮助,可以揭示m6A在细胞分化和发育中的具体作用。